
In der Anaphase beginnt die Teilung der Metaphasechromosomen, dadurch werden die bisherigen Schwesterchromatiden zu unabhängigen Tochterchromosomen. Diese wandern dann entlang der Kinetochor-Mikrotubuli zu den Spindelpolen.
Der Transport der Tochterchromosomen entlang der Kinetochor-Mikrotubuli basiert nicht auf einer Zugwirkung der Mikrotubuli, sondern erfolgt mit Hilfe von Motorproteinen am Kinetochor unter Verbrauch von ATP.
Die Verkürzung der Kinetochor-Mikrotubuli hingegen ist ein Prozess der parallel zum Chromosomentransport verläuft und von diesem unabhängig ist. siehe auch: Aufbau der Mikrotubuli)
"Während die Tochterchromosomen unter Verkürzung der Kinetochor-Mikrotubuli polwärts wandern, entfernen sich zusätzlich auch die Pole selbst von einander. Diese Bewegung beruht auf der sog. Stemmkörperwirkung der Pol-Mikrotubuli in der Überlappungszone der Spindelmitte."(Peter H. Raven; Ray F. Evert ; Helena Curtis (2000):Biologie der Pflanzen. 2., verb. Aufl. de Gruyter. Berlin, S.178.)
Die in der Überlappungszone antiparallel liegenden Pol-Mikrotubuli sind mit einem Motorprotein (Kinesin-ähnlich) assoziiert, welches unter ATP- Verbrauch die Spindelhälften auseinander drückt.